Плодопитомник был основан в 1998 году группой садоводов-энтузиастов. В далеком 1998 году плодопитомник находился в с. Сампур Сампурского района Тамбовской области и не имел своего современного названия. Тогда выращивались только саженцы яблони всего лишь 8 сортов. Постепенно количество выращиваемых культур и сортов расширялось. В связи с тем, что выращиваемые саженцы ориентированы на Центральный и Центрально-черноземный регионы было принято решение о перемещении питомника в более северный район области. По ряду причин выбор остановился на “Чистых прудах”. Так вместе с переездом плодопитомник получил свое название.
В настоящее время в плодопитомнике выращивается достаточно обширный список культур и сортов плодово-ягодных растений (более двухсот).
Перечень культур и сортов плодопитомника постоянно пополняется. “Новоселы” плодопитомника в первую очередь проходят апробацию, т.е. мы не размножаем новые сорта до тех пор, пока не получим объективных данных о растениях в условиях нашего плодопитомника (средняя полоса России). В пределах апробации плодово-ягодные растения проверяются по ряду важных параметров таких, как: качество плодов (вкус, размер, внешний вид, сроки хранения); размер растения и форма кроны; устойчивость к заболеваниям и неблагоприятным факторам окружающей среды, и ряду других параметров. Одним из важнейших параметров при проведении апробации является установление реальной зимостойкости сорта.
Для дальнейшего размножения отбираются только те сорта и культуры, которые максимально приспособлены к климатическим условиям центральной полосы России и дают плоды высокого качества.
В апреле 2014 года плодовый питомник "Чистые пруды" подарил саженцы яблони школе-интернату в с. Красненькое Тамбовского района Тамбовской области, и теперь там будет яблоневый сад. Подробности в сюжете телекомпании "Новый век" г. Тамбов.
